Beschreibung: Shinji ist die Hauptfigur in NGE und die wohl interessanteste Persönlichkeit in dem Anime. Seine Mutter starb bei einem Unfall mit EVA 01 als Shinji gerade 3 Jahre alt war. Sein Vater schickte ihn daraufhin zu seinem Lehrer um dort weiterzuleben, während er sich ganz NERV widmete. Der Junge begann, seinen Vater dafür zu hassen und er kümmerte sich immer weniger um seine Umwelt und kapselte sich von allem ab. Heute ist er am liebsten alleine und fühlt sich am wohlsten, wenn er keinen Menschen um sich herum hat und er keinen Kontakt zu anderen hat. Er ist ein Einzelgänger und kann daher auch nur schlecht mit seinen Mitmenschen umgehen. 
Eines Tages dann ließ Gendo Ikari seinen Sohn zu NERV nach Tokyo-3 holen, weil er ihn als Piloten für EVA 01 brauchte und so ist es auch nicht verwunderlich, dass Shinji sich erst weigerte, die Evangelion Unit zu betreten. Doch letztendlich sieht er ein, dass er den riesigen Koloss steuern muss, schon alleine weil er nicht will, dass die schwer verletzte Rei es versucht. Doch seinen ersten Kampf verliert Shinji und EVA 01 läuft das erste Mal Amok und tötet den Engel. Seit dem wohnt Shinji bei Misato Katsuragi, die für ihn wie eine Art Ersatzmutter wird. In der Schule lernt er dann auch Toji und Kensuke kennen und auch zu Rei schließt er so etwas wie Freundschaft, doch ist er immer noch sehr schüchtern und kapselt sich gerne ab. Vor allem mit Asuka hat Shinji große Probleme, da diese ihn andauernd ärgert und provoziert, doch bleibt bis zum Schluss nicht klar, was er wirklich für sie fühlt. 
Sein einzig wahrer Freund wird Kaworu, doch ausgerechnet diese ist ein Engel und bittet schließlich Shinji, ihn umzubringen. In Neon Genesis Evangelion versucht Shinji mehrfach, einfach zu gehen, wegzulaufen, doch dann kehrt er doch zurück, um seinem Vater und vor allem um sich selber zu beweisen, dass er zu etwas nützlich ist.

Beschreibung: Neben Shinji die zweite interessante Persönlichkeit in NGE, denn Rei unterscheidet sich von allen anderen Kindern. Ihr Gesichtsausdruck ändert sich nie und sie zeigt auch nie Gefühle, noch ist sie sehr gesprächig. Einzig Gendo Ikari ist ihr wichtig und umgekehrt kümmert sich Gendo um so mehr um sie. 
Im Laufe der Serie versucht Rei, die Wahrheit über sich herauszufinden, da sie fühlt, dass sie anders als normale Menschen ist. Sie erfährt, dass sie von NERV fest in das Projekt zur Optimierung der Menschheit eingeplant wurde und nach einiger Zeit realisiert sie auch, dass sie gar kein richtiger Mensch ist, sondern ein Klon, geklont aus Shinjis verstorbener Mutter Yui. Gleichzeitig stecken in ihrer Seele Teile des zweiten Engels, Lilith. Nur sie, Gendo Ikari, Kaji und Ritsuko wissen, was sich im Terminal Dogma der NERV Zentrale befindet, nämlich Adam, Lilith und die Lanze des Longinus. Genau wie Shinji ist Rei ein Einzelgänger, sie kümmert sich nicht um ihre Umwelt und lebt in einer trostlosen Wohnung. Auch ihre Gefühle zu Gendo sind sehr gespalten, auf der einen Seite hasste sie ihn dafür, dass er sie ausnutzt, aber auf der anderen Seite ist sie auch glücklich darüber, dass er sie erschaffen hat.
Ihr Körper ist beliebig austauschbar, so lange ihre Seele überlebt, einmal stirbt sie, als Ritsukos Mutter sie umbringt und ein zweites Mal, als sie Shinji mit der Explosion von EVA 00 das Leben rettet.

Beschreibung: Geboren in Deutschland, verließ ihr Vater die Familie schon sehr früh. Ihre Mutter konnte diesen Verlust nicht verkraften und erlitt schwere Psychische Schäden nach einem Unfall, vermutlich mit der Einheit 02. Danach unterhielt sich ihre Mutter immer mit einer Tochter, die sie für ihre Tochter hielt und irgendwann erhang sie sich in einer Klinik. Asuka wurde bei einer Pflegefamilie untergebracht und wurde später als Second Children auserwählt, EVA 02 zu steuern. Daraufhin kam sie zusammen mit der EVA Unit nach Japan, wobei sie schon auf dem Weg nach Japan ihr Talent zeigen musste, als die Eskorte von einem Engel angegriffen wurde.
Asukas hat ein viel zu großes Selbstbewusstsein und so ist es auch nicht verwunderlich, dass sie sich für besser alles alle anderen hält. Insbesondere ist sie der Meinung, dass sie die bester der Piloten ist und so kann sie es auch nicht ertragen, dass Shinji und Rei mit der Zeit eine bessere Synchronrate erreichen, als sie selber. Erst zum Schluss von NGE realisiert Asuka, dass sie nicht die anderen sondern vor allem sich selber so sehr hasst und deshalb EVA 02 steuert, um sich selber zu beweisen, dass ihr Leben überhaupt einen Sinn hat. Sie bemerkt auch nicht, dass EVA 02 auch ein Lebewesen ist (bzw. sie weiß es einfach nicht) und so ist es auch nicht verwunderlich, dass sie den Riesen wie ein Stück Spielzeug behandelt.
Erst der Engel Arael führt den Zuschauer in die tiefen von Asukas Psyche, dass sie immer noch ein Trauma von dem Selbstmord ihrer Mutter hat und durch die Psychoattacke des Engels ist es Asuka auch später nicht mehr möglich, EVA 02 zu steuern, erst in End of Evangelion, als sie bemerkt, dass die Seele ihrer Mutter in EVA 02 steckt.

Beschreibung: Auf den ersten Blick könnte man diesen Jungen als ganz normal bezeichnen, von ihm sind keine seelischen Schäden bekannt und auch keine traurige oder traumatische Kindheit. Nur: er ist ein Engel! Er wirkt immer freundlich und ist sehr kontaktfreudig und sucht auch den Kontakt zu anderen Menschen, vor allem zu Shinji. Und im Gegensatz zu den anderen Engeln wünscht er sich nicht das Ende der Menschheit, sondern ist vielmehr darauf hinaus, etwas über sie zu lernen und zu erfahren.
Während seiner sehr kurzen Zeit bei NERV freundet er sich schnell mit Shinji an und akzeptiert ihn so wie er ist, nämlich introvertiert und sehr still. Kaworu erkennt schnell Shinjis Seelenleben und versucht ihn so gut es geht zu helfen und ihn von seinen Ängsten zu befreien.

Beschreibung: Ihr Vater war es, der die Expedition leitete, die Adam fand und den Second Impact auslöste. Ihr Vater schleppte sie mit letzter Kraft in eine Rettungskapsel und rettet so ihr Leben und opferte sich selber für seine Tochter. Erst nach vielen Jahren überwand sie das traumatische Erlebnis und begann wieder, ganz normal zu leben und sie freundete sich damals mit Ritsuko an. Diese lernt sie während ihres Studiums kennen und in dieser Zeit hat sie auch eine Beziehung mit Kaji, die sie aber beendet, nachdem sie in ihm ihren Vater sieht. Sie hat einen ausgeprägten Mutterinstinkt und kümmert sich sehr um Shinji, nicht zuletzt weil dieser ihr Leid tut. Doch auch ihr gelingt es nicht, vollständig in Shinji vorzudringen und ihn zu verstehen.
Obwohl sie leicht chaotisch wirkt und es auch nicht so mit Pünktlichkeit hat, ist sie eine von NERVs wichtigsten Militärstrategen, denn ihr kommen zum großen Teil die zündenden Ideen, mit denen schließlich die Engel besiegt werde, so zum Beispiel im Kampf gegen den 5. Engel, wo sie auf die Idee kommt, das Positronengewehr zu benutzen. Sie versucht sich immer um die Children zu kümmern, doch weiß sie im Gegensatz zu Ritsuko und Gendo nichts über die wahren Hintergründe von NERV und sie weiß auch nicht wirklich, was die EVAs überhaupt sind, geschweige denn weiß sie etwas von der Existenz von Adam und Lilith im Terminal Dogma

Beschreibung: Schon Ritsukos Mutter war Mitarbeiter bei NERV gewesen und war maßgeblich an der Entwicklung der EVAs beteiligt und sie baute den Supercomputer im Central Dogma, Magi. Dieser besteht aus drei Persönlichkeiten, die ihre Mutter hat, ihre Person als Frau, als Mutter und als Wissenschaftlerin. Doch eines Tages starb sie unter mysteriösen Umständen und Ritsuko übernahm ihre Stelle bei NERV.
Ihre Aufgabe bei NERV ist es unter anderem, dass die EVAs einsatzfähig sind und alle Daten ausgewertet werden, um möglichst viel über die Engel zu erfahren, außerdem für die Überwachung der Piloten im Zusammenhang mit ihren Einheiten, d.h. sie überwacht die regelmäßigen Synchron-Tests. etc. 
Man erfährt nicht sehr viel über Dr. Akagi, nur dass sie scheinbar für ihre Arbeit lebt und auch so recht kühl ist. Da sie und ihre Mutter an der Entwicklung von NERV und den EVAs beteiligt war, weiß sie auch sehr viel über die Absichten und Pläne von NERV und SEELE und versucht diese hauptsächlich vor Misato zu vertuschen.
Zum Schluss verliert sie allerdings die Kontrolle und die Geschichte mit NERV entgleitet langsam. Letztendlich fährt sie hinunter in das Terminal Dogma und vernichtet das Dummy Plug-System und somit alle von Reis Klonen.

Beschreibung: Er war einer der ersten Mitglieder der Organisationen NERV und SEELE und lernt Fuyutsuki, seinem Assistenten und seine Frau Yui noch vor dem Second Impact kennen. Er arbeitet zusammen mit Yui an dem Plan zur Optimierung der Menschheit und als seine Frau auf tragische Art und Weise starb, arbeitete er mit umso größerem Eifer daran, sich wieder mit ihr zu vereinen. Er schickte seinen Sohn Shinji weg und trat erst dann wieder mit ihm in Kontakt, als er ihn als Piloten für EVA 01 brauchte.
Seine Ziele blieben aber bis zum Schluss ein wenig verdeckt, denn zum einen verhindert er mit aller Kraft, dass durch das Eindringen der Engel der Third Impact ausgelöst wird, und doch versucht er zum Schluss, ihn mit Hilfe von Rei selber auszulösen. Auf ihm lastet wohl die größte Verantwortung bei NERV und trotz seiner Distanz zu irgendwelchen Gefühlen trifft er mehr als nur einmal die richtige Entscheidung, wenn diese auch nicht immer die Menschlichsten sind.